AOE (All Of gene Expression)

AOE (All Of gene Expression)とは

AOE (All Of gene Expression)は、公共遺伝子発現データベースの目次です。

( http://aoe.dbcls.jp/ )

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AOE (All Of gene Expresssion)の特徴

  • 遺伝子発現データベースの中身をひと目で
    • ヒストグラムからデータを選択、項目を選択してリスト表示することができます。
  • 登録データランキングでより探しやすく
    • 生物種ごと、手法ごとのデータ数のランキングを一覧できます。
  • 動的なグラフ描画
    • クリック操作で見たい生物種、手法に絞り込んだヒストグラムが動的に表示されます。

利用例

  • 生物種別登録データランキングを眺める。
  • Mus musculusをクリックしてマウスのデータだけの登録件数推移を概観する。
  • 手法別登録データランキングでIlluminaとOthers_NGSだけを選択することでNGSによる遺伝子発現データのみの推移を描画する。
  • 選択した項目をリスト表示して、オリジナルのデータに素早くアクセスする。

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今後の開発予定

  • DNA Data Bank of Japan(DDBJ) の遺伝子発現データベースとの協力・連携体制を強化し、公共遺伝子発現データのメタ解析結果を盛り込んでいく予定です。

参考文献

統合TV 「AOEを使って遺伝子発現データベースの統計を見ながら検索する」DOI: 10.7875/togotv.2014.096