OntoFinder & OntoFactory

OntoFinder & OntoFactoryとは

「既存のオントロジーに基づくマイオントロジーの作成」を支援するためのウェブサービスです。検索ツールのOntoFinderと検索結果エディターのOntoFactoryから構成されています。

( http://ontofinder.dbcls.jp )

サンプル1 サンプル2

OntoFinder & OntoFactoryの特徴

  • OntoFinder
    • マイデータ(タームのリスト)をTSV(Tab-separated values)フォーマットで入力し、関連するオントロジーを検索
    • 数百までのタームで一度に検索可能(300程度まで確認済み)
    • BioPortalに登録されている全てのオントロジーが検索対象
    • 入力されたマイデータとの関連性により検索結果のオントロジーをランク付け
  • OntoFactory
    • 自動的にランク付けされたオントロジーの検索結果をdrag&dropで編集可能
    • 検索結果のオントロジーからオントロジータームを収集し、OWLでダウンロード可能

利用例

  • BioPortalに登録されている既存Ontologyを利用したマイオントロジーの構築

今後の開発予定

  • 今後サービス予定のBioPortal-mirror@NBDCとの連携による検索結果ブラウジングの高速化
  • BioPortalに登録されてないオントロジーへの対応
  • オントロジー(タームセット)間の関係の視覚化
  • 自動ランキングの改善(より頻繁に使われるオントロジーを優先)
  • 編集途中の中間結果の保存機能
  • オントロジータームをsub-tree毎に一括して編集できる機能