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基本情報
活動
センターにおける活動
今はインディーズでも、真ん中に躍り出るよ。
- Gendoo
(Gene,
Disease
Features
Ontology-based
Overview System)
遺伝子や疾患について、関連する疾患、薬剤、臓器、生命現象などの特徴を
キーワードでリスト表示するシステム。
この遺伝子なんなんだか、とか、この疾患についてざっくり知りたい、と
いう時に。
- バイオ系データ解析@localhost
ライフサイエンス統合データベースセンターの明日を担う人材である
AJACS (All Japan Annotator/Curator/System DB administrator) のうち
S (System DB administrator) のためのコンテンツ。
ライフサイエンス系のサービス、データベースを構築、維持、管理できるような
System DB administrator (システムデータベース管理者)を養成するのが目的。
東大による
System DB administrator 構築者養成プログラム
受講記録をもとにもろもろ拡張中。
- バイオ用語辞典
昔に作ったのがあるので、それをきれいにして公開しようかと。(作業中)
- バイオ系イラスト集
ポスターなどに使える細胞だの、チャネルだの、実験器具だのの画像集(作業中)
研究内容
- 文献情報などを活用しての遺伝子、疾患への機能情報やその表現
たとえば、マイクロアレイデータの解析で得られた遺伝子リストについて、
生物学的に何なのよ、という話。
Publications
- Kato T., Chang MH, Kurita Y, Nakada T, Ogoshi M,
Nakazato T., Doi H, Hirose S, Romero M. F.,
Identification of renal transporters involved in sulfate excretion
in marine teleolost fish.
American Journal of Physiology,
Integrative and Comparative Physiology,
297 (12): R1647-59, (2009).
[PubMed]
[Full Text]
- Nakazato T., Bono H., Matsuda H., Takagi T.,
Gendoo: Functional profiling of gene and disease features
using MeSH vocabulary.
Nucleic Acids Research,
37 (Suppl. 2) [Web Server Issue]: W166-W169, (2009).
[PubMed]
[Full Text]
- Nakazato T., Takinaka T., Mizuguchi H.,
Matsuda H., Bono H., Asogawa M.,
BioCompass: A novel functional inference tool that utilizes MeSH hierarchy
to analyze groups of genes.
In Silico Biology,
8 (1): 53-61, (2008).
[PubMed]
[Full Text]
- Hirata T., Kaneko T., Ono T., Nakazato T.,
Furukawa N., Hasegawa S., Wakabayashi S., Shigekawa M., Chang MH.,
Romero M. F., Hirose S.,
Mechanism of acid adaptation of a fish living in a pH 3.5 lake
American Journal of Physiology,
Integrative and Comparative Physiology,
284 (5): R1199-212, (2003).
[PubMed]
[Full Text]
その他
-
BUGJA
(BioPerl Users Group in Japan)
経歴
学歴
| 平成4年4月1日 | 都立戸山高等学校 入学 |
| 平成7年3月15日 | 都立戸山高等学校 卒業 |
| 平成8年4月1日 | 東京工業大学 生命理工学部 入学 |
| 平成12年3月27日 | 東京工業大学 生命理工学部
生体機構学科 卒業 |
| 平成12年4月1日 | 東京工業大学大学院
生命理工学研究科
生体システム専攻
修士課程 入学
|
| 平成14年3月26日 | 東京工業大学大学院
生命理工学研究科
生体システム専攻
修士課程 修了
|
| 平成17年10月1日 | 大阪大学大学院
情報科学研究科
バイオ情報工学専攻
博士後期課程 入学
|
| 平成20年9月25日 | 大阪大学大学院
情報科学研究科
バイオ情報工学専攻
博士後期課程 修了
|
学位
- 学士(理学)
恐山ウグイにおける酸性適応機構の解明(平成12年3月)
… 多分、こんな感じのタイトルだったように思う
- 修士(理学)
ウナギにおける硫酸トランスポーターの解析と海水適応に果たす役割
(平成14年3月26日)
- 博士(情報科学)
疾患関連遺伝子探索のためのMeSHによる遺伝子・疾患情報解析手法に関する研究
(平成20年9月25日)
職歴
| 平成14年4月1日 |
日本電気株式会社 (NEC) 入社 |
| 平成19年9月15日 |
日本電気株式会社 (NEC) 退職 |
| 平成19年9月16日 |
大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構
ライフサイエンス統合データベースセンター 特任技術専門員 |
| 平成21年4月1日 |
大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構
ライフサイエンス統合データベースセンター 特任研究員 |
|
現在に至る |
NEC時代は、バイオインフォマティクス系の、研究所と事業部の間の組織で
ソフト開発だのテクニカルマーケティングだのをやっていました。
(学生時代のウェット時代に対して、ドライ時代)
最後の半年は、(部署の一部解体に伴って)営業支援の部署に移されて
いろいろなプロジェクトの青写真を焼く、というような戦略系の仕事を
してました。(いわゆる冬の時代。しかし、ここで学んだものも大きかった)
資格
- 高等学校教諭専修免許状(理科)[H14.3.26]
- 画像処理技能検定画像処理部門2級(画像処理検定2級)
(現
CGエンジニア検定 画像処理部門 2級相当)[H17.7.15]
- 画像処理技能検定マルチメディア部門2級(マルチメディア検定2級)
(現
マルチメディア検定 エキスパート相当)[H17.7.15]
- Microsoft Certified Associate (MCA) Network
… 昔、とらされたが、それだけ。[H14.6.25]
まぁ、いらん情報ばかりなのですが、今後 履歴書 書くときにここにあると
便利なのでご容赦くださいませ。

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