「TogoVar」のデータアップデートのお知らせ
2024. 06. 27 /
ヒトゲノムバリアントの統合データベース「TogoVar」https://togovar.org/では、機能追加、データ拡充を継続的に実施しています。この度、以下のようにデータをアップデートしましたので、お知らせします。
-
理化学研究所が解析したバイオバンクジャパン第一コホート47疾患のSNPアレイにより決定されたゲノム情報のうち、45疾患のアレル頻度およびgenotype count（疾患別ならびに男女別）を、疾患ごとの情報としてJGA-SNP に追加しました。理化学研究所が解析したgenotypingデータは、NBDCヒトデータベースのJGAS000114 / JGAD000123として登録されています。
-
ナショナルセンター・バイオバンクネットワーク(NCBN)がサンプルの収集と全ゲノム解析を実施した9,290人の日本人のアレル頻度およびgenotype countをNCBNデータセットとして新たに追加しました（GRCh38のみ）。同頻度データはNBDCヒトデータベースのhum0331.v1.freq.v1として登録され当該データのページからダウンロードできます。
詳細は、TogoVarウェブサイトのHistory（更新履歴） をご覧ください。