「TogoVar」機能追加のお知らせ
2025. 06. 05 /
ヒトゲノムバリアントの統合データベース「TogoVar」https://togovar.org/ では、機能追加、データ拡充を継続的に実施しています。この度、以下のように機能を追加しましたので、お知らせします。
- MoG+ (Mouse genome database with high added value) に登録されているマウスバリアントとTogoVarのヒトバリアントの対応関係を遺伝子ページに掲載しました（例：BRCA2遺伝子）。対応関係はUCSC Chain Fileに基づいています。ヒトのミスセンスバリアントや病原性バリアントに対応するマウスバリアントを持つ実験マウス系統の探索が可能になりました。MoG+は理化学研究所バイオリソースセンターが開発・運用しています。
- Protein browserを遺伝子ページに追加しました （例：BRCA2遺伝子）。以下のデータが比較しやすいようにアミノ酸配列上に整列表示されています。
- ミスセンスバリアントとその病原性 (情報源：TogoVar)
- リン酸化部位（情報源：jPOST: Japan ProteOme STandard Repository/Database)
- 糖鎖結合部位（情報源：糖鎖科学ポータル GlyCosmos）
- 疾患関連バリアント（情報源：UniProt）
- バリアントページのURL指定方法を拡張しました。例えば、以下のURLでtgv47264307のページが表示されます。
- 染色体番号、塩基位置、参照アレル、代替アレルによる指定
- dbSNP rs番号による指定